Protein–RNA interactions for Protein: P0DMP2

SRGAP2B, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2BP0DMP2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms