Protein–RNA interactions for Protein: P0DJJ0

SRGAP2C, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2CP0DJJ0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SRGAP2CP0DJJ0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRGAP2CP0DJJ0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRGAP2CP0DJJ0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRGAP2CP0DJJ0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms