Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SAA2P0DJI9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms