Protein–RNA interactions for Protein: P0CAP2

POLR2M, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2MP0CAP2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR2MP0CAP2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms