Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PTPRCP08575 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PTPRCP08575 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PTPRCP08575 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRCP08575 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRCP08575 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRCP08575 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRCP08575 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRCP08575 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRCP08575 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRCP08575 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRCP08575 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRCP08575 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRCP08575 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRCP08575 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRCP08575 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRCP08575 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRCP08575 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRCP08575 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRCP08575 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRCP08575 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRCP08575 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRCP08575 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRCP08575 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRCP08575 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRCP08575 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRCP08575 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRCP08575 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRCP08575 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRCP08575 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRCP08575 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRCP08575 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRCP08575 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRCP08575 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRCP08575 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRCP08575 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRCP08575 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRCP08575 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRCP08575 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRCP08575 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRCP08575 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRCP08575 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRCP08575 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRCP08575 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRCP08575 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRCP08575 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRCP08575 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
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