Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP3P08254 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP3P08254 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP3P08254 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP3P08254 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP3P08254 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP3P08254 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP3P08254 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP3P08254 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP3P08254 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP3P08254 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP3P08254 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP3P08254 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP3P08254 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP3P08254 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP3P08254 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMP3P08254 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMP3P08254 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMP3P08254 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMP3P08254 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMP3P08254 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP3P08254 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP3P08254 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP3P08254 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP3P08254 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP3P08254 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP3P08254 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP3P08254 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP3P08254 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP3P08254 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP3P08254 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP3P08254 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP3P08254 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP3P08254 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MMP3P08254 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MMP3P08254 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MMP3P08254 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MMP3P08254 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MMP3P08254 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MMP3P08254 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MMP3P08254 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MMP3P08254 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MMP3P08254 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP3P08254 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP3P08254 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP3P08254 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP3P08254 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP3P08254 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP3P08254 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP3P08254 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP3P08254 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP3P08254 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP3P08254 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP3P08254 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP3P08254 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP3P08254 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP3P08254 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP3P08254 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP3P08254 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP3P08254 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP3P08254 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP3P08254 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP3P08254 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP3P08254 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP3P08254 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP3P08254 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP3P08254 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP3P08254 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP3P08254 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP3P08254 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP3P08254 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP3P08254 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP3P08254 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP3P08254 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP3P08254 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP3P08254 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP3P08254 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP3P08254 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP3P08254 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP3P08254 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP3P08254 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP3P08254 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP3P08254 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP3P08254 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP3P08254 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP3P08254 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP3P08254 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP3P08254 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP3P08254 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP3P08254 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP3P08254 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP3P08254 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP3P08254 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP3P08254 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP3P08254 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP3P08254 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP3P08254 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP3P08254 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP3P08254 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP3P08254 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms