Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSLP07711 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSLP07711 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSLP07711 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSLP07711 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSLP07711 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSLP07711 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSLP07711 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSLP07711 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSLP07711 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSLP07711 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSLP07711 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSLP07711 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSLP07711 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSLP07711 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSLP07711 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSLP07711 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSLP07711 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSLP07711 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSLP07711 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSLP07711 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSLP07711 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSLP07711 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSLP07711 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSLP07711 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSLP07711 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSLP07711 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSLP07711 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSLP07711 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSLP07711 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSLP07711 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSLP07711 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSLP07711 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSLP07711 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSLP07711 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSLP07711 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSLP07711 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSLP07711 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSLP07711 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSLP07711 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSLP07711 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSLP07711 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSLP07711 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSLP07711 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSLP07711 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSLP07711 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSLP07711 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSLP07711 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSLP07711 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSLP07711 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSLP07711 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSLP07711 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSLP07711 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSLP07711 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSLP07711 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSLP07711 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSLP07711 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSLP07711 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSLP07711 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSLP07711 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSLP07711 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSLP07711 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSLP07711 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSLP07711 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSLP07711 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSLP07711 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSLP07711 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSLP07711 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSLP07711 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSLP07711 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSLP07711 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSLP07711 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSLP07711 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSLP07711 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSLP07711 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSLP07711 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSLP07711 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSLP07711 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSLP07711 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSLP07711 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSLP07711 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSLP07711 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSLP07711 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTSLP07711 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTSLP07711 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTSLP07711 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSLP07711 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSLP07711 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSLP07711 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSLP07711 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSLP07711 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSLP07711 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSLP07711 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSLP07711 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSLP07711 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSLP07711 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSLP07711 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSLP07711 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSLP07711 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSLP07711 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms