Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLBP06746 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLBP06746 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLBP06746 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLBP06746 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLBP06746 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLBP06746 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLBP06746 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLBP06746 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLBP06746 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLBP06746 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLBP06746 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLBP06746 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLBP06746 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLBP06746 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLBP06746 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLBP06746 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLBP06746 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLBP06746 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLBP06746 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLBP06746 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLBP06746 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLBP06746 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLBP06746 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLBP06746 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLBP06746 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLBP06746 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLBP06746 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLBP06746 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLBP06746 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLBP06746 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLBP06746 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLBP06746 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLBP06746 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLBP06746 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLBP06746 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLBP06746 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLBP06746 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLBP06746 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLBP06746 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLBP06746 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POLBP06746 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLBP06746 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLBP06746 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLBP06746 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POLBP06746 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLBP06746 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLBP06746 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLBP06746 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLBP06746 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLBP06746 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLBP06746 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLBP06746 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLBP06746 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLBP06746 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLBP06746 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLBP06746 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLBP06746 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLBP06746 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLBP06746 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLBP06746 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLBP06746 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLBP06746 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POLBP06746 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POLBP06746 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLBP06746 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLBP06746 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLBP06746 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLBP06746 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLBP06746 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLBP06746 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLBP06746 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLBP06746 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLBP06746 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
POLBP06746 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLBP06746 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLBP06746 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLBP06746 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLBP06746 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLBP06746 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLBP06746 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLBP06746 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLBP06746 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLBP06746 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLBP06746 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POLBP06746 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLBP06746 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POLBP06746 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POLBP06746 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLBP06746 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLBP06746 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLBP06746 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLBP06746 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLBP06746 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLBP06746 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLBP06746 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLBP06746 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLBP06746 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
POLBP06746 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLBP06746 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms