Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
IFNA4P05014 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
IFNA4P05014 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFNA4P05014 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFNA4P05014 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
IFNA4P05014 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFNA4P05014 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
IFNA4P05014 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFNA4P05014 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFNA4P05014 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFNA4P05014 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFNA4P05014 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFNA4P05014 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFNA4P05014 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFNA4P05014 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFNA4P05014 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 269.8 ms