Protein–RNA interactions for Protein: P02745

C1QA, Complement C1q subcomponent subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QAP02745 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C1QAP02745 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1QAP02745 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1QAP02745 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1QAP02745 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1QAP02745 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1QAP02745 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1QAP02745 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1QAP02745 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C1QAP02745 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1QAP02745 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1QAP02745 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1QAP02745 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1QAP02745 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1QAP02745 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1QAP02745 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C1QAP02745 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1QAP02745 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1QAP02745 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1QAP02745 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1QAP02745 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1QAP02745 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1QAP02745 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1QAP02745 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C1QAP02745 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1QAP02745 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1QAP02745 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1QAP02745 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1QAP02745 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1QAP02745 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1QAP02745 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1QAP02745 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1QAP02745 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1QAP02745 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1QAP02745 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1QAP02745 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1QAP02745 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1QAP02745 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1QAP02745 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1QAP02745 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.11
C1QAP02745 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C1QAP02745 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1QAP02745 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1QAP02745 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C1QAP02745 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1QAP02745 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1QAP02745 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1QAP02745 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1QAP02745 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1QAP02745 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C1QAP02745 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1QAP02745 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1QAP02745 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1QAP02745 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1QAP02745 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
C1QAP02745 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C1QAP02745 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C1QAP02745 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1QAP02745 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1QAP02745 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1QAP02745 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C1QAP02745 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1QAP02745 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C1QAP02745 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1QAP02745 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1QAP02745 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1QAP02745 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1QAP02745 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1QAP02745 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1QAP02745 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1QAP02745 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1QAP02745 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1QAP02745 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1QAP02745 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QAP02745 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QAP02745 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QAP02745 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QAP02745 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QAP02745 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QAP02745 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QAP02745 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QAP02745 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QAP02745 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QAP02745 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QAP02745 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QAP02745 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QAP02745 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QAP02745 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1QAP02745 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1QAP02745 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1QAP02745 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1QAP02745 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1QAP02745 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1QAP02745 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1QAP02745 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1QAP02745 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1QAP02745 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1QAP02745 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1QAP02745 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1QAP02745 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms