Protein–RNA interactions for Protein: P02708

CHRNA1, Acetylcholine receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA1P02708 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNA1P02708 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNA1P02708 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNA1P02708 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNA1P02708 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNA1P02708 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA1P02708 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA1P02708 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA1P02708 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA1P02708 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA1P02708 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA1P02708 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA1P02708 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA1P02708 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA1P02708 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA1P02708 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA1P02708 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA1P02708 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA1P02708 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA1P02708 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA1P02708 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA1P02708 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA1P02708 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA1P02708 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA1P02708 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA1P02708 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA1P02708 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA1P02708 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA1P02708 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA1P02708 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHRNA1P02708 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA1P02708 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHRNA1P02708 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHRNA1P02708 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHRNA1P02708 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHRNA1P02708 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHRNA1P02708 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA1P02708 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA1P02708 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA1P02708 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA1P02708 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA1P02708 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA1P02708 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA1P02708 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms