Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOC3P02656 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC3P02656 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC3P02656 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC3P02656 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC3P02656 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC3P02656 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC3P02656 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC3P02656 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC3P02656 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC3P02656 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC3P02656 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC3P02656 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC3P02656 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC3P02656 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC3P02656 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC3P02656 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC3P02656 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC3P02656 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC3P02656 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC3P02656 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC3P02656 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC3P02656 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC3P02656 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC3P02656 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC3P02656 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC3P02656 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC3P02656 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC3P02656 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC3P02656 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC3P02656 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC3P02656 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC3P02656 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC3P02656 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC3P02656 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC3P02656 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC3P02656 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC3P02656 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC3P02656 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC3P02656 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC3P02656 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC3P02656 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC3P02656 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC3P02656 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC3P02656 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC3P02656 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC3P02656 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC3P02656 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC3P02656 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC3P02656 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC3P02656 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC3P02656 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC3P02656 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC3P02656 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC3P02656 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC3P02656 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC3P02656 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC3P02656 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC3P02656 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC3P02656 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC3P02656 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC3P02656 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC3P02656 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC3P02656 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC3P02656 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC3P02656 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC3P02656 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC3P02656 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC3P02656 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC3P02656 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC3P02656 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC3P02656 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC3P02656 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC3P02656 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC3P02656 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC3P02656 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC3P02656 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC3P02656 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC3P02656 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC3P02656 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC3P02656 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC3P02656 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC3P02656 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC3P02656 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC3P02656 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC3P02656 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC3P02656 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC3P02656 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC3P02656 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC3P02656 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC3P02656 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC3P02656 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC3P02656 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC3P02656 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC3P02656 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC3P02656 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC3P02656 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC3P02656 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC3P02656 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
APOC3P02656 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms