Protein–RNA interactions for Protein: P01834

IGKC, Immunoglobulin kappa constant, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKCP01834 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKCP01834 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKCP01834 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKCP01834 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKCP01834 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKCP01834 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKCP01834 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKCP01834 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKCP01834 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKCP01834 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKCP01834 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKCP01834 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKCP01834 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKCP01834 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKCP01834 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKCP01834 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKCP01834 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKCP01834 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKCP01834 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKCP01834 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKCP01834 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKCP01834 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKCP01834 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKCP01834 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKCP01834 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKCP01834 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKCP01834 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKCP01834 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKCP01834 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKCP01834 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKCP01834 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKCP01834 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKCP01834 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKCP01834 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKCP01834 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKCP01834 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKCP01834 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKCP01834 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKCP01834 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKCP01834 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKCP01834 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKCP01834 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKCP01834 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKCP01834 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKCP01834 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKCP01834 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKCP01834 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKCP01834 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKCP01834 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKCP01834 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKCP01834 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKCP01834 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKCP01834 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKCP01834 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKCP01834 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKCP01834 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKCP01834 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKCP01834 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKCP01834 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKCP01834 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKCP01834 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKCP01834 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKCP01834 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKCP01834 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKCP01834 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKCP01834 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKCP01834 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGKCP01834 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGKCP01834 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGKCP01834 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGKCP01834 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGKCP01834 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGKCP01834 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGKCP01834 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGKCP01834 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGKCP01834 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGKCP01834 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGKCP01834 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGKCP01834 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGKCP01834 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKCP01834 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKCP01834 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKCP01834 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKCP01834 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKCP01834 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKCP01834 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKCP01834 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKCP01834 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKCP01834 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKCP01834 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKCP01834 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKCP01834 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKCP01834 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKCP01834 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKCP01834 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKCP01834 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKCP01834 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKCP01834 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKCP01834 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKCP01834 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms