Protein–RNA interactions for Protein: P01258

CALCA, Calcitonin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCAP01258 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALCAP01258 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALCAP01258 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALCAP01258 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALCAP01258 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALCAP01258 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALCAP01258 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALCAP01258 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALCAP01258 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALCAP01258 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALCAP01258 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALCAP01258 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALCAP01258 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CALCAP01258 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALCAP01258 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALCAP01258 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALCAP01258 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALCAP01258 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALCAP01258 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALCAP01258 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALCAP01258 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALCAP01258 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALCAP01258 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALCAP01258 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALCAP01258 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALCAP01258 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CALCAP01258 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALCAP01258 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALCAP01258 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALCAP01258 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CALCAP01258 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALCAP01258 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALCAP01258 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALCAP01258 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CALCAP01258 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALCAP01258 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALCAP01258 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALCAP01258 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALCAP01258 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALCAP01258 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALCAP01258 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALCAP01258 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALCAP01258 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALCAP01258 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALCAP01258 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALCAP01258 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALCAP01258 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CALCAP01258 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALCAP01258 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALCAP01258 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALCAP01258 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALCAP01258 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALCAP01258 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALCAP01258 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALCAP01258 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALCAP01258 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALCAP01258 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALCAP01258 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALCAP01258 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALCAP01258 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALCAP01258 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CALCAP01258 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CALCAP01258 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CALCAP01258 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CALCAP01258 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALCAP01258 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALCAP01258 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALCAP01258 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALCAP01258 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALCAP01258 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CALCAP01258 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALCAP01258 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALCAP01258 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALCAP01258 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALCAP01258 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALCAP01258 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALCAP01258 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALCAP01258 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALCAP01258 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALCAP01258 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALCAP01258 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALCAP01258 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALCAP01258 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALCAP01258 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALCAP01258 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALCAP01258 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALCAP01258 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALCAP01258 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALCAP01258 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALCAP01258 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALCAP01258 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALCAP01258 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALCAP01258 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CALCAP01258 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALCAP01258 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALCAP01258 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCAP01258 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCAP01258 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCAP01258 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCAP01258 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms