Protein–RNA interactions for Protein: P00746

CFD, Complement factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP00746 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFDP00746 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFDP00746 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFDP00746 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFDP00746 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFDP00746 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFDP00746 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFDP00746 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFDP00746 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFDP00746 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFDP00746 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFDP00746 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFDP00746 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFDP00746 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFDP00746 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFDP00746 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFDP00746 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFDP00746 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFDP00746 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFDP00746 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFDP00746 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFDP00746 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFDP00746 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFDP00746 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFDP00746 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFDP00746 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFDP00746 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFDP00746 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFDP00746 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFDP00746 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFDP00746 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFDP00746 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFDP00746 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFDP00746 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFDP00746 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFDP00746 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFDP00746 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFDP00746 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFDP00746 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFDP00746 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFDP00746 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFDP00746 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFDP00746 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFDP00746 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFDP00746 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFDP00746 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFDP00746 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFDP00746 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFDP00746 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFDP00746 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFDP00746 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFDP00746 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFDP00746 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFDP00746 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CFDP00746 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFDP00746 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFDP00746 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFDP00746 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFDP00746 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFDP00746 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CFDP00746 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFDP00746 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFDP00746 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFDP00746 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFDP00746 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CFDP00746 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFDP00746 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFDP00746 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFDP00746 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFDP00746 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFDP00746 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFDP00746 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFDP00746 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFDP00746 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CFDP00746 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFDP00746 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFDP00746 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFDP00746 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFDP00746 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFDP00746 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFDP00746 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFDP00746 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFDP00746 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFDP00746 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFDP00746 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFDP00746 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CFDP00746 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFDP00746 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFDP00746 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFDP00746 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFDP00746 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFDP00746 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFDP00746 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFDP00746 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFDP00746 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFDP00746 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFDP00746 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFDP00746 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CFDP00746 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFDP00746 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms