Protein–RNA interactions for Protein: P00736

C1R, Complement C1r subcomponent, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RP00736 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1RP00736 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1RP00736 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1RP00736 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1RP00736 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1RP00736 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1RP00736 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1RP00736 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1RP00736 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1RP00736 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1RP00736 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1RP00736 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1RP00736 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1RP00736 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1RP00736 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1RP00736 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1RP00736 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1RP00736 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1RP00736 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1RP00736 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1RP00736 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1RP00736 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1RP00736 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1RP00736 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1RP00736 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1RP00736 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1RP00736 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1RP00736 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1RP00736 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1RP00736 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C1RP00736 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1RP00736 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1RP00736 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1RP00736 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1RP00736 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1RP00736 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1RP00736 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1RP00736 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
C1RP00736 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1RP00736 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1RP00736 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
C1RP00736 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1RP00736 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1RP00736 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1RP00736 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1RP00736 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1RP00736 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1RP00736 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1RP00736 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1RP00736 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1RP00736 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1RP00736 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1RP00736 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1RP00736 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1RP00736 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1RP00736 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1RP00736 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1RP00736 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1RP00736 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1RP00736 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1RP00736 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1RP00736 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1RP00736 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1RP00736 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1RP00736 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1RP00736 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1RP00736 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1RP00736 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1RP00736 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1RP00736 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1RP00736 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1RP00736 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1RP00736 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1RP00736 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1RP00736 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1RP00736 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1RP00736 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C1RP00736 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1RP00736 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1RP00736 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1RP00736 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1RP00736 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1RP00736 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1RP00736 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1RP00736 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1RP00736 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1RP00736 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1RP00736 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1RP00736 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1RP00736 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1RP00736 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1RP00736 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C1RP00736 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1RP00736 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1RP00736 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1RP00736 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1RP00736 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1RP00736 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1RP00736 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1RP00736 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms