Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEC24BO95487 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms