Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC24AO95486 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms