Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CLDN7O95471 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN7O95471 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN7O95471 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN7O95471 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN7O95471 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN7O95471 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN7O95471 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN7O95471 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN7O95471 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN7O95471 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN7O95471 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN7O95471 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN7O95471 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN7O95471 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN7O95471 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN7O95471 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN7O95471 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN7O95471 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN7O95471 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN7O95471 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN7O95471 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN7O95471 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN7O95471 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN7O95471 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN7O95471 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN7O95471 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN7O95471 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN7O95471 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN7O95471 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN7O95471 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN7O95471 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN7O95471 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN7O95471 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN7O95471 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN7O95471 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN7O95471 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN7O95471 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN7O95471 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN7O95471 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN7O95471 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN7O95471 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN7O95471 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN7O95471 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms