Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ABCB11O95342 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms