Protein–RNA interactions for Protein: O94779

CNTN5, Contactin-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN5O94779 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms