Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GCATO75600 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCATO75600 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCATO75600 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCATO75600 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCATO75600 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCATO75600 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCATO75600 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCATO75600 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCATO75600 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCATO75600 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCATO75600 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCATO75600 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCATO75600 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCATO75600 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCATO75600 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCATO75600 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCATO75600 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCATO75600 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCATO75600 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCATO75600 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCATO75600 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCATO75600 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCATO75600 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GCATO75600 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCATO75600 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCATO75600 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCATO75600 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCATO75600 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCATO75600 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCATO75600 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCATO75600 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCATO75600 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCATO75600 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCATO75600 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCATO75600 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCATO75600 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GCATO75600 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCATO75600 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCATO75600 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCATO75600 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCATO75600 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCATO75600 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCATO75600 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCATO75600 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCATO75600 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GCATO75600 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCATO75600 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCATO75600 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCATO75600 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCATO75600 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GCATO75600 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GCATO75600 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCATO75600 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCATO75600 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCATO75600 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCATO75600 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCATO75600 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCATO75600 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCATO75600 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GCATO75600 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GCATO75600 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCATO75600 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCATO75600 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCATO75600 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCATO75600 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCATO75600 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCATO75600 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCATO75600 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCATO75600 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCATO75600 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCATO75600 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCATO75600 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCATO75600 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCATO75600 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCATO75600 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCATO75600 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCATO75600 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCATO75600 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCATO75600 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCATO75600 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GCATO75600 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCATO75600 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GCATO75600 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GCATO75600 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
GCATO75600 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCATO75600 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GCATO75600 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCATO75600 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCATO75600 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCATO75600 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCATO75600 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GCATO75600 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCATO75600 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCATO75600 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCATO75600 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCATO75600 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCATO75600 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GCATO75600 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCATO75600 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms