Protein–RNA interactions for Protein: O75192

PEX11A, Peroxisomal membrane protein 11A, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11AO75192 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PEX11AO75192 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PEX11AO75192 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PEX11AO75192 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PEX11AO75192 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PEX11AO75192 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PEX11AO75192 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PEX11AO75192 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PEX11AO75192 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PEX11AO75192 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PEX11AO75192 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PEX11AO75192 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PEX11AO75192 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PEX11AO75192 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PEX11AO75192 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PEX11AO75192 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PEX11AO75192 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PEX11AO75192 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PEX11AO75192 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PEX11AO75192 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PEX11AO75192 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PEX11AO75192 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PEX11AO75192 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PEX11AO75192 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PEX11AO75192 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PEX11AO75192 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PEX11AO75192 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PEX11AO75192 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PEX11AO75192 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PEX11AO75192 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PEX11AO75192 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PEX11AO75192 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PEX11AO75192 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PEX11AO75192 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PEX11AO75192 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PEX11AO75192 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms