Protein–RNA interactions for Protein: O60840

CACNA1F, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, humanhuman

Predictions only

Length 1,977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1FO60840 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CACNA1FO60840 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CACNA1FO60840 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CACNA1FO60840 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CACNA1FO60840 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CACNA1FO60840 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CACNA1FO60840 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CACNA1FO60840 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CACNA1FO60840 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CACNA1FO60840 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CACNA1FO60840 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CACNA1FO60840 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CACNA1FO60840 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CACNA1FO60840 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CACNA1FO60840 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CACNA1FO60840 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CACNA1FO60840 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CACNA1FO60840 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CACNA1FO60840 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CACNA1FO60840 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CACNA1FO60840 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CACNA1FO60840 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACNA1FO60840 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACNA1FO60840 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACNA1FO60840 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACNA1FO60840 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACNA1FO60840 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CACNA1FO60840 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CACNA1FO60840 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACNA1FO60840 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACNA1FO60840 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACNA1FO60840 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CACNA1FO60840 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CACNA1FO60840 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CACNA1FO60840 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CACNA1FO60840 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CACNA1FO60840 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CACNA1FO60840 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CACNA1FO60840 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CACNA1FO60840 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CACNA1FO60840 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CACNA1FO60840 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CACNA1FO60840 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CACNA1FO60840 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CACNA1FO60840 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CACNA1FO60840 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CACNA1FO60840 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms