Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR5O60602 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR5O60602 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TLR5O60602 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TLR5O60602 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TLR5O60602 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TLR5O60602 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TLR5O60602 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TLR5O60602 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TLR5O60602 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TLR5O60602 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TLR5O60602 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TLR5O60602 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TLR5O60602 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TLR5O60602 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TLR5O60602 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TLR5O60602 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TLR5O60602 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TLR5O60602 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TLR5O60602 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TLR5O60602 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TLR5O60602 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TLR5O60602 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TLR5O60602 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TLR5O60602 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLR5O60602 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLR5O60602 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLR5O60602 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLR5O60602 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLR5O60602 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLR5O60602 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLR5O60602 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLR5O60602 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLR5O60602 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLR5O60602 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLR5O60602 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TLR5O60602 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLR5O60602 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLR5O60602 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLR5O60602 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLR5O60602 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLR5O60602 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLR5O60602 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLR5O60602 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLR5O60602 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLR5O60602 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TLR5O60602 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLR5O60602 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLR5O60602 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR5O60602 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR5O60602 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR5O60602 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR5O60602 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR5O60602 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR5O60602 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR5O60602 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR5O60602 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR5O60602 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR5O60602 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR5O60602 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR5O60602 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR5O60602 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR5O60602 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR5O60602 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR5O60602 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR5O60602 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR5O60602 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR5O60602 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR5O60602 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR5O60602 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR5O60602 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR5O60602 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR5O60602 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR5O60602 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR5O60602 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR5O60602 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR5O60602 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR5O60602 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR5O60602 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR5O60602 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR5O60602 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR5O60602 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR5O60602 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR5O60602 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLR5O60602 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLR5O60602 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLR5O60602 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLR5O60602 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TLR5O60602 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLR5O60602 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLR5O60602 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLR5O60602 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLR5O60602 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLR5O60602 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLR5O60602 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLR5O60602 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLR5O60602 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLR5O60602 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TLR5O60602 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TLR5O60602 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms