Protein–RNA interactions for Protein: O60239

SH3BP5, SH3 domain-binding protein 5, humanhuman

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Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5O60239 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
SH3BP5O60239 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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SH3BP5O60239 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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SH3BP5O60239 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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SH3BP5O60239 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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SH3BP5O60239 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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SH3BP5O60239 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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SH3BP5O60239 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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SH3BP5O60239 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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SH3BP5O60239 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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