Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KCNQ3O43525 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KCNQ3O43525 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms