Protein–RNA interactions for Protein: O43502

RAD51C, DNA repair protein RAD51 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51CO43502 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD51CO43502 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms