Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms