Protein–RNA interactions for Protein: O43236

SEPT4, Septin-4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT4O43236 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SEPT4O43236 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEPT4O43236 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEPT4O43236 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEPT4O43236 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEPT4O43236 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEPT4O43236 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEPT4O43236 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEPT4O43236 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEPT4O43236 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEPT4O43236 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEPT4O43236 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEPT4O43236 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEPT4O43236 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEPT4O43236 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEPT4O43236 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEPT4O43236 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SEPT4O43236 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEPT4O43236 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEPT4O43236 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEPT4O43236 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEPT4O43236 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEPT4O43236 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEPT4O43236 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SEPT4O43236 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEPT4O43236 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEPT4O43236 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEPT4O43236 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEPT4O43236 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEPT4O43236 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms