Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM6AO15550 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM6AO15550 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM6AO15550 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM6AO15550 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM6AO15550 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM6AO15550 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM6AO15550 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM6AO15550 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM6AO15550 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM6AO15550 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM6AO15550 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM6AO15550 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM6AO15550 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM6AO15550 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM6AO15550 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM6AO15550 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM6AO15550 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM6AO15550 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM6AO15550 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM6AO15550 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM6AO15550 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM6AO15550 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM6AO15550 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM6AO15550 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM6AO15550 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM6AO15550 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM6AO15550 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM6AO15550 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM6AO15550 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM6AO15550 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM6AO15550 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM6AO15550 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM6AO15550 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM6AO15550 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM6AO15550 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM6AO15550 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM6AO15550 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM6AO15550 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM6AO15550 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM6AO15550 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM6AO15550 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM6AO15550 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
KDM6AO15550 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
KDM6AO15550 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
KDM6AO15550 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
KDM6AO15550 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KDM6AO15550 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
KDM6AO15550 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms