Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ANKRD28O15084 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms