Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SYNJ2O15056 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SYNJ2O15056 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SYNJ2O15056 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SYNJ2O15056 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SYNJ2O15056 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SYNJ2O15056 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SYNJ2O15056 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SYNJ2O15056 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
SYNJ2O15056 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
SYNJ2O15056 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SYNJ2O15056 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SYNJ2O15056 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
SYNJ2O15056 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SYNJ2O15056 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SYNJ2O15056 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SYNJ2O15056 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
SYNJ2O15056 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
SYNJ2O15056 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC36.32■■■■□ 3.41
SYNJ2O15056 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
SYNJ2O15056 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.41
SYNJ2O15056 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC36.32■■■■□ 3.41
SYNJ2O15056 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC36.32■■■■□ 3.41
SYNJ2O15056 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
SYNJ2O15056 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
SYNJ2O15056 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
SYNJ2O15056 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
SYNJ2O15056 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
SYNJ2O15056 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SYNJ2O15056 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC36.31■■■■□ 3.4
SYNJ2O15056 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SYNJ2O15056 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
SYNJ2O15056 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SYNJ2O15056 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SYNJ2O15056 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
SYNJ2O15056 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SYNJ2O15056 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SYNJ2O15056 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SYNJ2O15056 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
SYNJ2O15056 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SYNJ2O15056 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SYNJ2O15056 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SYNJ2O15056 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
SYNJ2O15056 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SYNJ2O15056 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
SYNJ2O15056 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
SYNJ2O15056 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
SYNJ2O15056 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SYNJ2O15056 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SYNJ2O15056 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SYNJ2O15056 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SYNJ2O15056 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SYNJ2O15056 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SYNJ2O15056 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SYNJ2O15056 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SYNJ2O15056 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SYNJ2O15056 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
SYNJ2O15056 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
SYNJ2O15056 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
SYNJ2O15056 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
SYNJ2O15056 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
SYNJ2O15056 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
SYNJ2O15056 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
SYNJ2O15056 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
SYNJ2O15056 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SYNJ2O15056 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SYNJ2O15056 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SYNJ2O15056 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SYNJ2O15056 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SYNJ2O15056 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
SYNJ2O15056 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SYNJ2O15056 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SYNJ2O15056 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SYNJ2O15056 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SYNJ2O15056 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SYNJ2O15056 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SYNJ2O15056 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SYNJ2O15056 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SYNJ2O15056 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SYNJ2O15056 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SYNJ2O15056 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SYNJ2O15056 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
SYNJ2O15056 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SYNJ2O15056 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SYNJ2O15056 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SYNJ2O15056 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SYNJ2O15056 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
SYNJ2O15056 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SYNJ2O15056 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SYNJ2O15056 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SYNJ2O15056 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SYNJ2O15056 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
SYNJ2O15056 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SYNJ2O15056 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SYNJ2O15056 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SYNJ2O15056 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SYNJ2O15056 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SYNJ2O15056 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SYNJ2O15056 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
SYNJ2O15056 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms