Protein–RNA interactions for Protein: O14983

ATP2A1, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A1O14983 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2A1O14983 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2A1O14983 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2A1O14983 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2A1O14983 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2A1O14983 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2A1O14983 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2A1O14983 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2A1O14983 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2A1O14983 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2A1O14983 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2A1O14983 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2A1O14983 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2A1O14983 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2A1O14983 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2A1O14983 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2A1O14983 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2A1O14983 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2A1O14983 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2A1O14983 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2A1O14983 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2A1O14983 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2A1O14983 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2A1O14983 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2A1O14983 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2A1O14983 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2A1O14983 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2A1O14983 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2A1O14983 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2A1O14983 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2A1O14983 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2A1O14983 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2A1O14983 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2A1O14983 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2A1O14983 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2A1O14983 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms