Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC30.45■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
POLR3AO14802 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
POLR3AO14802 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
POLR3AO14802 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
POLR3AO14802 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
POLR3AO14802 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
POLR3AO14802 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
POLR3AO14802 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
POLR3AO14802 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
POLR3AO14802 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
POLR3AO14802 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
POLR3AO14802 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
POLR3AO14802 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
POLR3AO14802 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
POLR3AO14802 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
POLR3AO14802 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
POLR3AO14802 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC30.42■■■□□ 2.46
POLR3AO14802 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
POLR3AO14802 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
POLR3AO14802 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
POLR3AO14802 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
POLR3AO14802 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
POLR3AO14802 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
POLR3AO14802 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
POLR3AO14802 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
POLR3AO14802 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
POLR3AO14802 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
POLR3AO14802 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
POLR3AO14802 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
POLR3AO14802 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
POLR3AO14802 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
POLR3AO14802 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
POLR3AO14802 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
POLR3AO14802 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
POLR3AO14802 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
POLR3AO14802 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
POLR3AO14802 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
POLR3AO14802 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
POLR3AO14802 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms