Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms