Protein–RNA interactions for Protein: O00295

TULP2, Tubby-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP2O00295 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TULP2O00295 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TULP2O00295 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TULP2O00295 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TULP2O00295 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TULP2O00295 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TULP2O00295 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TULP2O00295 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TULP2O00295 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TULP2O00295 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TULP2O00295 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TULP2O00295 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TULP2O00295 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TULP2O00295 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TULP2O00295 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TULP2O00295 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TULP2O00295 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TULP2O00295 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TULP2O00295 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TULP2O00295 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TULP2O00295 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TULP2O00295 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TULP2O00295 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TULP2O00295 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TULP2O00295 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TULP2O00295 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TULP2O00295 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TULP2O00295 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TULP2O00295 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TULP2O00295 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TULP2O00295 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TULP2O00295 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TULP2O00295 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TULP2O00295 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TULP2O00295 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TULP2O00295 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TULP2O00295 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TULP2O00295 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TULP2O00295 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TULP2O00295 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TULP2O00295 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TULP2O00295 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TULP2O00295 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TULP2O00295 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TULP2O00295 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TULP2O00295 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TULP2O00295 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TULP2O00295 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TULP2O00295 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TULP2O00295 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TULP2O00295 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TULP2O00295 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TULP2O00295 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TULP2O00295 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TULP2O00295 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TULP2O00295 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TULP2O00295 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TULP2O00295 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TULP2O00295 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TULP2O00295 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TULP2O00295 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TULP2O00295 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TULP2O00295 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TULP2O00295 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TULP2O00295 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TULP2O00295 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TULP2O00295 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TULP2O00295 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TULP2O00295 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TULP2O00295 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TULP2O00295 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TULP2O00295 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TULP2O00295 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TULP2O00295 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TULP2O00295 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TULP2O00295 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TULP2O00295 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TULP2O00295 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TULP2O00295 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TULP2O00295 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TULP2O00295 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TULP2O00295 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TULP2O00295 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TULP2O00295 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TULP2O00295 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TULP2O00295 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TULP2O00295 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TULP2O00295 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TULP2O00295 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TULP2O00295 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TULP2O00295 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TULP2O00295 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TULP2O00295 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TULP2O00295 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TULP2O00295 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TULP2O00295 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TULP2O00295 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TULP2O00295 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TULP2O00295 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TULP2O00295 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms