Protein–RNA interactions for Protein: H7C0C1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0C1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H7C0C1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H7C0C1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H7C0C1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H7C0C1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H7C0C1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H7C0C1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
H7C0C1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H7C0C1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H7C0C1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H7C0C1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H7C0C1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H7C0C1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H7C0C1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H7C0C1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H7C0C1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H7C0C1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H7C0C1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H7C0C1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H7C0C1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
H7C0C1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H7C0C1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H7C0C1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H7C0C1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H7C0C1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H7C0C1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H7C0C1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H7C0C1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H7C0C1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H7C0C1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H7C0C1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
H7C0C1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H7C0C1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H7C0C1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H7C0C1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H7C0C1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H7C0C1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H7C0C1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H7C0C1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H7C0C1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H7C0C1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H7C0C1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H7C0C1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H7C0C1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
H7C0C1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H7C0C1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H7C0C1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H7C0C1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H7C0C1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H7C0C1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H7C0C1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H7C0C1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H7C0C1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H7C0C1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H7C0C1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H7C0C1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H7C0C1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H7C0C1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H7C0C1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
H7C0C1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
H7C0C1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H7C0C1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H7C0C1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H7C0C1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H7C0C1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H7C0C1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H7C0C1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H7C0C1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H7C0C1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H7C0C1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H7C0C1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H7C0C1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
H7C0C1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H7C0C1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H7C0C1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H7C0C1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H7C0C1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H7C0C1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H7C0C1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H7C0C1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H7C0C1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H7C0C1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H7C0C1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H7C0C1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H7C0C1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H7C0C1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H7C0C1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H7C0C1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H7C0C1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H7C0C1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H7C0C1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H7C0C1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H7C0C1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H7C0C1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H7C0C1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H7C0C1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H7C0C1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H7C0C1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H7C0C1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H7C0C1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms