Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PATL2C9JE40 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms