Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
B4DGG1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
B4DGG1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
B4DGG1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
B4DGG1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
B4DGG1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
B4DGG1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
B4DGG1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
B4DGG1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
B4DGG1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
B4DGG1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
B4DGG1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
B4DGG1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
B4DGG1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
B4DGG1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
B4DGG1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
B4DGG1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
B4DGG1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
B4DGG1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
B4DGG1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
B4DGG1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
B4DGG1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
B4DGG1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
B4DGG1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
B4DGG1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
B4DGG1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
B4DGG1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
B4DGG1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
B4DGG1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
B4DGG1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
B4DGG1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
B4DGG1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
B4DGG1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
B4DGG1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
B4DGG1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
B4DGG1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
B4DGG1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
B4DGG1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
B4DGG1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
B4DGG1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
B4DGG1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
B4DGG1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
B4DGG1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
B4DGG1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
B4DGG1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
B4DGG1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
B4DGG1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
B4DGG1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
B4DGG1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
B4DGG1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
B4DGG1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
B4DGG1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
B4DGG1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
B4DGG1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
B4DGG1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
B4DGG1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
B4DGG1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
B4DGG1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
B4DGG1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
B4DGG1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
B4DGG1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
B4DGG1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
B4DGG1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
B4DGG1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
B4DGG1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
B4DGG1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
B4DGG1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
B4DGG1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
B4DGG1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
B4DGG1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
B4DGG1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
B4DGG1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
B4DGG1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
B4DGG1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
B4DGG1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
B4DGG1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
B4DGG1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
B4DGG1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4DGG1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4DGG1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4DGG1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4DGG1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4DGG1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4DGG1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4DGG1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4DGG1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
B4DGG1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4DGG1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4DGG1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4DGG1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4DGG1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4DGG1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4DGG1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4DGG1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4DGG1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4DGG1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4DGG1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4DGG1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4DGG1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4DGG1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms