Protein–RNA interactions for Protein: B2RBV5

Putative MORF4 family-associated protein 1-like protein UPP, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B2RBV5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
B2RBV5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
B2RBV5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
B2RBV5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
B2RBV5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
B2RBV5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
B2RBV5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
B2RBV5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
B2RBV5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
B2RBV5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
B2RBV5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
B2RBV5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
B2RBV5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
B2RBV5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
B2RBV5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
B2RBV5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
B2RBV5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
B2RBV5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
B2RBV5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
B2RBV5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
B2RBV5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
B2RBV5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
B2RBV5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
B2RBV5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
B2RBV5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
B2RBV5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
B2RBV5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
B2RBV5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
B2RBV5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
B2RBV5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
B2RBV5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
B2RBV5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
B2RBV5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
B2RBV5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
B2RBV5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
B2RBV5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
B2RBV5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
B2RBV5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
B2RBV5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
B2RBV5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
B2RBV5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
B2RBV5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
B2RBV5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
B2RBV5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
B2RBV5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
B2RBV5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
B2RBV5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
B2RBV5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
B2RBV5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
B2RBV5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
B2RBV5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
B2RBV5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
B2RBV5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
B2RBV5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
B2RBV5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
B2RBV5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
B2RBV5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
B2RBV5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
B2RBV5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B2RBV5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B2RBV5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B2RBV5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B2RBV5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B2RBV5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
B2RBV5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B2RBV5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
B2RBV5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
B2RBV5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
B2RBV5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B2RBV5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B2RBV5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B2RBV5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
B2RBV5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B2RBV5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
B2RBV5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
B2RBV5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
B2RBV5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
B2RBV5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
B2RBV5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
B2RBV5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
B2RBV5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
B2RBV5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
B2RBV5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
B2RBV5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
B2RBV5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
B2RBV5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
B2RBV5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
B2RBV5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
B2RBV5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
B2RBV5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
B2RBV5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
B2RBV5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
B2RBV5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
B2RBV5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
B2RBV5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
B2RBV5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
B2RBV5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
B2RBV5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
B2RBV5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
B2RBV5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms