Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF839A8K0R7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms