Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC85CA6NKD9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC85CA6NKD9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC85CA6NKD9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC85CA6NKD9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC85CA6NKD9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC85CA6NKD9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC85CA6NKD9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC85CA6NKD9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC85CA6NKD9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC85CA6NKD9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms