Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCNX2A6NKB5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms