Protein–RNA interactions for Protein: A6NIE6

RRN3P2, Putative RRN3-like protein RRN3P2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P2A6NIE6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRN3P2A6NIE6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRN3P2A6NIE6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRN3P2A6NIE6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRN3P2A6NIE6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRN3P2A6NIE6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRN3P2A6NIE6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms