Protein–RNA interactions for Protein: A6NGU7

LINC01546, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01546, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01546A6NGU7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01546A6NGU7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01546A6NGU7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01546A6NGU7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01546A6NGU7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01546A6NGU7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01546A6NGU7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01546A6NGU7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01546A6NGU7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01546A6NGU7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01546A6NGU7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01546A6NGU7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01546A6NGU7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01546A6NGU7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01546A6NGU7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01546A6NGU7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01546A6NGU7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01546A6NGU7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01546A6NGU7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01546A6NGU7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01546A6NGU7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01546A6NGU7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01546A6NGU7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01546A6NGU7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC01546A6NGU7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC01546A6NGU7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC01546A6NGU7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC01546A6NGU7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms