Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms