Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms