Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms