Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MAP1LC3B2A6NCE7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MAP1LC3B2A6NCE7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms